Io esporto i miei cartamodelli in pdf, salvando una copia. Li salvo sia in formato A4 con un mio metodo, sia in formato da stampare in copisteria. Nessuno mi ha mai fatto problemi, e anche i miei cartamodelli in genere sono in bianco e nero, raramente utilizzo colori.
E li faccio con Windows 10, ho anche un portatile con Ubuntu ma in genere lì faccio altre cose.
Edit: ti suggerisco anche di provare così, in Windows 10: invece di salvare, in Inkscape vai su Stampa>Microsoft Print to PDF e vedere se questo risolve il tuo problema.