Inkscape è un programma open source per il disegno, simile a Illustrator, Freehand, CorelDraw e Xara X che si basa sul formato standard W3C "Scalable Vector Graphics" (SVG).
Accidenti questa è una cosa che mi stuzzica (avere una CNC) ma non ho spazio in casa.Nel frattempo sarebbe utile sapere la fonte da dove hai seguito la procedura, in modo che si possa dare un'occhiata.Visto che necessiti di file .dxf hai provato ad utilizzare direttamente un software CAD ? (con Linux io utilizzo con molta soddisfazione Librecad)
non è che ti salva il file generato nella cartella di sistema UTENTE ? hai verificato?