Ne hai due, nel senso che hai due account nel computer, giusto? In questo caso meglio utilizzare la cartella dell'account principale.
Comunque la cartella compressa di Inkstitch va estratta in questo percorso: Utenti>Tuonome>AppData>Roaming>Inkscape>extensions
Facendo così a me funziona perfettamente l'estensione. Se hai fatto così e hai problemi, secondo me dipende da tutta la spazzatura che Windows mantiene nel suo sistema.
Quindi in questo caso devi disinstallare Inkscape, cancellare la cartella Inkscape in Roaming di cui sopra (tanto poi si ricrea), pulire il registro (io utilizzo CCleaner) e reinstallare di nuovo Inkscape.
Fatto questo, e avendo un'installazione pulita del programma, estrai la cartella compressa di Inkstitch nel percorso di cui sopra.
Ti ho chiesto se sapevi aprire la cartella AppData perché è una cartella di sistema, e va maneggiata con cura. Infatti ad un altro utente non mi sono sentita di suggerire ciò, perché non conosceva bene Windows.