Ciao e benvenuto robertlover...
Eh si... vecchio problema di Inkscape.. misura gli oggetti considerando anche lo spessore del bordo.. Dovrebbe essere risolto con la 0.49, se si decidono a farla uscire..
L'unica soluzione è togliere i contorni, lasciando solo i riempimenti, allinearle come vuoi, e poi alla fine rimettere i contorni..